Если слои в прямом смысле, то через LIE (Layred Image Editor), в любом из окошек выбора текстурных карт. В принципе в дальнейшем можно и как слоёный мат пользовать, но лучше запечённую карту сохранить - LIE затягивает загрузку мата, оно не фатально, но бесит!
А если добавить опцию в мат, то наверно в Шейдер миксере.

Как опцию.
Я такое видел на каком-то пейзаже. Там помимо стандартного набора ещё несколько слоёв со своими параметрами, текстурами и масками.
Да и Анестис мне сегодня написал про дополнительные слои в его будущем NGS3 (а переспросить я постеснялся, чтоб дураком не выглядеть :D).

Что-то я недопонял. Имеются в виду слои текстурных карт, или разные слои материалов на одной поверхности?
Если второе, то теоретически (да в общем-то и практически) оно возможно (через Джиометри Эдитор Тул), только смысла в этом мало от слова нет - работать будет какой-то один из них, причём порядка я не понял, а бленд из этих квазислоёв по-моему никак не приготовить.
Вообще с этим мутно всё, и главное непонятно зачем когда почти всё нужное можно в базовом ИР шейдере найти. Даже добавить чего-нибудь, или наоборот, выпилить.

Имеются виду дополнительные слои в шейдере поверхности.
Т/е, в списке параметров есть ещё некий "слой" со своим набором параметров.
Сейчас попытаюсь вспомнить, где я это видел...

Значит в Джиометри Эдитор дорога...

Вспомнил...
"FernLake" Стоунмейсона http://www.daz3d.com/fern-lake .
Там на почве 3 лишних слоя.

Так это отдельные поверхности, а layers - просто название, а не собственно слои.

Не уверен. Судя по иерархии, у объекта fpsTerrain поверхность только одна - "Terrain".
Если объекту fpsTerrain создать ещё одну (с помощью редактора геометрии), то она не включится в Terrain, а будет "лежать" рядом.

Точно, не обратил внимания. Значит в Шейдер миксер лезть. Для меня - лес тёмный.

Хреновенько. Я в эту штуку однажды заглянул... И закрыл. Тихонечко. Чтобы не проснулось. :D