Antony вообще про аудио глюки(кодеками) при кодировании, у меня возикалли проблемы только после перекодировки.У меня возникало несоответствие аудио и видео(прим.аудио раньше видео выходит).
Вот скачай эту версию пакета(но перед установкой советую полностью снести все старые кодеки, причем и папку из ключа C:\Program Files тоже.А потом уже ставь заново и перезагружайся.
K-Lite Codec Pack 2.69 Ful
Скачать:
http://www.skan.ru/file/klcodec269f.exe